msgid "" msgstr "" "Project-Id-Version: v1.22\n" "POT-Creation-Date: \n" "PO-Revision-Date: 2005-12-22 16:33+0800\n" "Last-Translator: Yin Gang \n" "Language-Team: \n" "MIME-Version: 1.0\n" "Content-Type: text/plain; charset=utf-8\n" "Content-Transfer-Encoding: 8bit\n" "X-Poedit-Language: Chinese\n" "X-Poedit-Country: CHINA\n" ########################################## # Language: English (International) # FileID : $Id: zh_CN.po,v 1.3 2006/01/03 06:12:52 jens Exp $ # Author : Janus Kristensen # Email : jbk@visualgroup.dk ########################################## # For more information please see: # http://boinc.berkeley.edu/web_translation.php ########################################## # The charset used for the text in this file (please try to use UTF-8 if possible) msgid "CHARSET" msgstr "UTF-8" # The name of this language in this language msgid "LANG_NAME_NATIVE" msgstr "简体中文" # The name of this language in an international language (English) msgid "LANG_NAME_INTERNATIONAL" msgstr "Simplified Chinese" ########################################## # Language: Chinese (International) # FileID : # Author : Yin Gang # Email : # Last update: 11.06.2006 ########################################## # For more information please see: # http://boinc.berkeley.edu/translate.html ########################################## ######################################### # Front page (index.php, header.php, footer.php) ######################################### # Note: Be careful with the Angstrom sign: Å. It's possible that you see – or Å, instead in this file # (problem between unicode utf8 and iso 8859-1 in Kate, the KDE Text Editor and the HTML of the Rosetta web site). # Try Unicode utf8 or iso 8859-15 if you have this problem. msgid "RAH_WHAT_IS" msgstr "$PROJECT 是什么？" msgid "RAH_PROJ_DESC" msgstr "$PROJECT 需要你来帮助我们确定蛋白质的三维形状。这项工作将最终有助于寻找一些重大人类疾病的治疗方法。通过在你不使用计算机的时候运行 Rosetta 程序，你将可以加速并拓展我们的研究工作，而如果没有你们的帮助这都是无法做到的。你也将帮助我们设计新的蛋白质以对付如爱滋，疟疾，癌症和阿尔茨海默病等(更多信息请查看 %s疾病相关研究%s)。请%s加入我们%s！ $PROJECT 是非赢利项目。" # Join Rosetta@home part msgid "RAH_JOIN_TITLE" msgstr "参加 $PROJECT" msgid "RULES_POLICIES" msgstr "规定与政策" msgid "SYS_REQ" msgstr "系统需求" msgid "DOWN_INST" msgstr "下载，安装并运行BOINC" msgid "DOWN_INST_A" msgstr "输入项目网址" msgid "RAH_WELCOME" msgstr "来自 David Baker 的欢迎信" # About part msgid "RAH_TEN_REASONS" msgstr "十个加入我们的理由" msgid "RAH_GRAPHICS_GUIDE" msgstr "$PROJECT 及其图像的快速向导" msgid "FAQ" msgstr "常见问答" msgid "SCIENCE_FAQ" msgstr "科学常见问答" msgid "RAH_DISEASE" msgstr "相关疾病研究" msgid "RAH_RESEARCH_OVERVIEW" msgstr "研究概况" msgid "RAH_CYBERSCIENCE" msgstr "David Baker 档案 - 蛋白质折叠 (华盛顿大学 Cyberscience Symposium 文章)" msgid "RAH_NEWS_ART" msgstr "Rosetta 相关新闻 & 文章 " msgid "RAH_JOURNAL" msgstr "David Baker 的 $PROJECT 日记" msgid "TECH_NEWS" msgstr "技术新闻" # Returning participants part msgid "RAH_RETURN_PART_TITLE" msgstr "用户反馈" msgid "YOUR_ACCOUNT" msgstr "%s您的帐号%s - 查看统计，修改参数设置" msgid "TEAMS" msgstr "%s团队%s - 创建或参加一个团队" msgid "APPS" msgstr "计算程序" msgid "SERVER_STATUS" msgstr "服务器状态" msgid "ADD_ONS" msgstr "辅助程序" # Community part msgid "MSG_BOARDS" msgstr "留言板" msgid "Q_AND_A" msgstr "疑难解答" msgid "PART_PROF" msgstr "用户档案" msgid "IMAGES" msgstr "图片" msgid "LANGUAGES" msgstr "语言选择" # Statistics part msgid "DISABLED" msgstr "已被暂停" msgid "RUNNING" msgstr "正在运行" msgid "TOP_PART" msgstr "用户排名" msgid "TOP_COMP" msgstr "计算机排名" msgid "TOP_TEAMS" msgstr "团队排名" msgid "TOP_PREDICTIONS" msgstr "最佳预测" msgid "UOTD" msgstr "今日用户" # For down time msgid "RAH_MAINTENANCE" msgstr "$PROJECT 临时停机以进行维护。" msgid "RAH_MAINTENANCE_TRY_AGAIN" msgstr "请稍后再重试。" ################################ # Often used ################################ msgid "PROTEINS" msgstr "蛋白质" msgid "PROTEIN_FOLDING" msgstr "蛋白质折叠" msgid "PROTEIN_STRUCT_PRED" msgstr "蛋白质结构预测" msgid "PROTEIN_DESIGN" msgstr "蛋白质设计" msgid "INTRODUCTION" msgstr "介绍" msgid "NEWS" msgstr "新闻" msgid "MORE" msgstr "更多" msgid "NEWS_AVAILABLE_RSS" msgstr "您可能通过 %sRSS feed%s 来查看新闻。" msgid "HOME" msgstr "主页" msgid "JOIN" msgstr "参与" msgid "ABOUT" msgstr "关于本项目" msgid "PARTICIPANTS" msgstr "您的帐号" msgid "COMMUNITY" msgstr "社区" msgid "STATISTICS" msgstr "统计" msgid "RAH_HEAD_LOGIN" msgstr "登录/注销" msgid "BACK_TO_TOP" msgstr "回到顶部" ############################################ # rah_about.php page ########################################### msgid "RAH_ABOUT_A" msgstr "我们相信我们已经离精确地预测和设计蛋白质或复合物这一计算生物领域中的圣杯已经相当近。但为了做到这一点，我们需要大量的计算资源，甚至比世界上最大的超级计算机的计算能力还要强大。而这只有通过将无数像您一样的志愿者聚集在一起才能达成。" msgid "RAH_ABOUT_MORE" msgstr "更多详细信息，可以查看下面的链接：" msgid "RAH_ABOUT_WHY" msgstr "为什么要进行蛋白质及复合物的结构预测和设计？" msgid "RAH_ABOUT_B" msgstr "蛋白质是生命的基础构造，其功能和相互间的作用对于所有生物体的化学及生物结构和作用至关重要。蛋白质的功能和它与其它分子的相互作用很大程序是由其形状(三维结构)所决定的。蛋白质合成时只是一长串的氨基酸，然后只有在它折叠成错综复杂的球状结构后才能真正起作用。了解和预测主宰这一复杂的折叠过程的规则(包括主体的折叠以及旁链的填充)是当今生物学的核心问题之一。了解蛋白质的折叠和与其它分子的相互作用以及它的功能将可能有利于找到对付人类疾病的药物或治疗方法。目前实验中用 X 射线(X-ray crystallography )或核磁共振(nuclear magnetic resonance - NMR)方法来得到蛋白质的结构(%s结构基因组学%s)需要耗费大量的资金。如果可以通过计算来解决，将可以大量减少结构生物学研究的费用。蛋白质及复合物的结构设计也有相当大的理论和现实意义。只要能设计出全新的结构，就可能设计出新奇的分子机器 - 具备治疗、催化等方面功能的蛋白质。最后一个问题是是否所有可能的折叠都已在自然界中存在？或许还有一些完全不同的折叠也是可能的？理解主宰蛋白质折叠和设计的规则将有助于这个问题的解答。" msgid "RAH_ABOUT_WIKI" msgstr "请点击下面的维基链接及获取更多的信息： " msgid "RAH_ABOUT_ACCURACY" msgstr "我们的预测精度？" msgid "RAH_ABOUT_C" msgstr "Rosetta 已在蛋白质结构预测关键技术分析大赛(%sCASP%s)上多次被证明是最好的蛋白质三维结构预测方法之一，在蛋白质相互作用预测关键技术分析大赛(%sCAPRI%s)中也表现不错。CASP6 的%s亮点%s之一就是使用我们的高分辨率修正方法进行的初次盲测取得了相当不错的结果。相对短的序列(包含 76 个基)允许我们不仅对自然序列，同时也对许多同系物使用了全原子提炼方法。结构的最低能量簇中心和实际的结构相当接近(1.5 埃)。高精度修正方法将 RMSD 从 2.2 埃降低到了 1.5 埃。蛋白质核心处的旁链填充也是以类似于自然界的方式进行的。在 CAPRI 大赛上，给定两个已知会复合的蛋白质结构，要示预测出复合物的结构。%s我们预测出的复合物%s的主干部分准确度相当高！不仅主干的朝向预测几乎完美，接口处的旁链也都相当精确。我们的设计模型也能产生精确的结果。近期更让人激动的是可任意选择三维结构的全新蛋白质的设计。我们的方法已经用于对名为 %sTOP7%s 的包含 93 个基的蛋白质的全新的次序及结构设计。最终得到的 TOP7 是单节显性及折叠的，用 X 射线看到的 TOP7 的晶格结构与设计模型相当接近(RMSD 为 1.2 埃)。 " msgid "RAH_ABOUT_FUTURE" msgstr "长远计划" msgid "RAH_ABOUT_D" msgstr "我们的方法将在即将到来的 CASP 和 CAPRI 实验中进行检验，同时也将应用在我们的公共蛋白质结构预测服务器(%sRobetta%s)上。Robetta 当前正在被全世界数以千计的科学家们免费使用，并且已被近期的 CASP 实验证明为最好的结构预测服务器之一。如果 $PROJECT 有足够多的参与者，我们计划使用 $PROJECT 来提供计算资源，以减少 Robetta 服务器的压力，我们也将加入诸如设计和接合等目前由于计算能力有限而无法实现的功能。通过将 Robetta 和 $PROJECT 集成在一起，像您一样的志愿者将不仅可以帮助我们，还可以直接帮助世界各地的科学家们进行生物医学方面的重要研究，比如癌症、SARS、爱滋、疟疾等等。" msgid "RAH_ABOUT_FEEDBACK" msgstr "反馈用户" msgid "RAH_ABOUT_E" msgstr "作为参与者的你难道不想知道在你的计算机上完成的预测结果吗？你完成的最佳模型的精度如何？和其他参与者比较呢？它看上去是怎样的？它是否帮助到了谁？我们计划在 $PROJECT 的网站上提供类似的信息，可能的话，还将其关联到科学家提交的预测请求上。你现在已经可以知道你完成的任务量(“积分”)并且可以在我们的%s统计页面%s上与其他的参与者进行比较。" msgid "RAH_ABOUT_MOVIES" msgstr "观看 Rosetta 的预测过程视频(WMV 格式)" msgid "RAH_ABOUT_F" msgstr "%sfolding Ubiquitin%s (文件大小 4M), %sre-packing side-chains of TOP7%s (文件大小 2.4M), %sand %sselecting optimal side-chain rotamers for TOP7 (design)%s (文件大小 4.7M)." msgid "RAH_ABOUT_MOVIES_CREDIT" msgstr "注意：播放上列视频需要安装媒体播放器。视频由 Jens Meiler 创建。" ############################################ # rah_welcome.php page ########################################### msgid "RAH_WELC_TITLE" msgstr "来自 David Baker 的欢迎信" msgid "RAH_WELC_A" msgstr "欢迎您参加 $PROJECT 分布式计算项目！" msgid "RAH_WELC_B" msgstr "您的参与将帮助我们解决“蛋白质折叠”这个分子生物学难题。" msgid "RAH_WELC_C" msgstr "蛋白质是执行您身体几乎所有重要功能的微型机器。而要了解蛋白质的工作原理就得了解它们的构成。40多年前，人们就已经知道蛋白质的氨基酸序列决定了它们的结构。得益于最近刚完成的人类基因组计划，我们也已知道人类基因中所有蛋白质的氨基酸序列。 但是，我们仍几乎不可能从蛋白质的基因排序中准确分析或计算出他们的结构。 解决这个问题就像是科学界中的“圣杯”。 " msgid "RAH_WELC_D" msgstr "您或许从最近的科学杂志中已经得知，在最近的6个月里，我们在这个问题上取得了重大的进展。也就是说，我们有可能通过蛋白质的序列来计算出它们的结构。如果成功，这将给我们对生物活动的了解带来巨大影响，更重要的是，人类由此就可能找到重大疾病的治疗方法和疫苗！ 然后，要解决这个问题最大的绊脚石是需要相当长的计算时间。" msgid "RAH_WELC_E" msgstr "让我来解释一下这个项目的大致计算原理。打个比方，如果您是一名太空探险者并且刚发现了一颗新的行星，您被告知说您要寻找的东西在行星表面最低的地方。那您怎么找呢？一种方法是降落到那个星球某个地点，然后从降落点开始搜寻。但如果行星非常大，您的降落地点和目标地点很可能相当远。举个例子，假如您在地球上降落，很难说您一定就能降落在死海岸附近的地方，很可能你会掉到另一块大陆上。喜马拉雅山脉或撒哈拉沙漠都有可能是你的降落地点。但如果您有 10000 个探险人员呢？这些探险人员将随机降落在行星表面某个地方并在降落地点附件开始搜寻，然后向您汇报他们各自所找到的海拔最低点。那么，您找到真正最低点的可能性将会大大提高。而且，您送出的探险人员越多，成功的机率越大。" msgid "RAH_WELC_F" msgstr "回到我们的项目，现在要寻找的不是太空中行星表面的最低点，而是蛋白质所有可能的结构。蛋白质的构造方式有很多。因为蛋白质中有上百种地方可以以各种不同的方式进行弯曲或扭曲。但是不管可能性有多少，它们最终都将折叠成一种特定的结构，这样才能发挥它们的生物职能。而这些被“折叠”的结构都有一个特点，那就是它们的能量比其它可能的结构更低。所以我们要搜寻的不是最低的海拔位置，而是最低能量的结构，但在概念上这和我们上一段中给的例子是非常相似的。" msgid "RAH_WELC_G" msgstr "接下来将不难想像您的电脑会做些什么。计算的初始阶段，Rosetta 会在一块随机选择的能量带“降落”，然后在附近寻找能量最低点。最终 Rosetta 将把它找到的最低能量结构及相应的能量值发送回服务器。服务器将会比较所有送上来的低能量结构的能量，从而找到最低能量的蛋白质结构。" msgid "RAH_WELC_H" msgstr "起初，我们会利用一些最低能量结构已知的蛋白质（其结构是通过复杂而昂贵的实验方法得到的，详细的细节我将不在这里进行解释）。我们会将计算出来的蛋白质结构和实验中得到的结构进行比较，以检查是否相同。一旦我们知道为了找到最低能量的蛋白质结构需要进行多少的搜寻（用多少处理器处理多少时间），我们将使用这种方法来确定一些重要的、结构未知的蛋白质的构成。这项研究被誉为生物界中的“圣杯”。而有了您的帮助，我们能更快地摘取它。 " msgid "RAH_WELC_I" msgstr "现在您应该已经知道，这个最低能量的蛋白质结构只能有一个处理器找到。因为搜寻空间是如此之大，而可能性又是如此之多，这就像买彩票一样，中奖机率是很小的。您的电脑投入的时间越多，成功的机率就越大。我们将跟踪报道这些幸运的电脑。而电脑的拥有者也就是那位分布式计算者会得到特殊的通告和积分。详见我们的 %s最佳预测%s 页面。" msgid "RAH_WELC_J" msgstr "祝您“计算愉快”！ 还请您告知您的朋友和亲戚关于我们和分布式计算的消息。 让他们也加入进来。 Rosetta@Home 是最重要的科学项目之一，而且可以通过分布式计算来解决。" msgid "RAH_WELC_K" msgstr "再次感谢您的参与！！ " msgid "RAH_WELC_L" msgstr "华盛顿大学生物化学教授" msgid "RAH_WELC_M" msgstr "Howard Hughes 医学院研究员" msgid "RAH_WELC_DAVID_PROF" msgstr "David Baker 档案" ###########################################" # rah_science_faq.php ########################################## #QC=Question C, AC=Answer C msgid "RAH_SC_FAQ_A" msgstr "由 Vanita Sood 编写" msgid "RAH_SC_FAQ_QA" msgstr "什么是 Rosetta ？" msgid "RAH_SC_FAQ_AA" msgstr "Rosettta 是一个蛋白质结构预测及设计软件。" msgid "RAH_SC_FAQ_QB" msgstr "什么是蛋白质？ " msgid "RAH_SC_FAQ_AB" msgstr "蛋白质是由氨基酸组成的复合物，由基因进行编码。" msgid "RAH_SC_FAQ_QC" msgstr "什么是氨基酸？" msgid "RAH_SC_FAQ_AC" msgstr "氨基酸是组成蛋白质的化学根。总共有 20 多种有特定基因的氨基酸。这 20 多种氨基酸依据属性不同可分成不同的类别：酸性或是碱性，亲水或是亲油。" msgid "RAH_SC_FAQ_QD" msgstr "蛋白质有什么用途？" msgid "RAH_SC_FAQ_AD" msgstr "生物体中细胞的基本功能都是由蛋白质完成的。它们通过DNA对基因进行复制和保持，它们帮助细胞生长和分裂，并防止细胞生长过多，它们赋予细胞特定的身份(比如肝脏、神经元、胰腺等等)，它们也帮助细胞间的交换。当蛋白质发生变异或者被毒素感染，就会引发诸如癌症或阿尔茨海默氏痴呆等疾病。细菌或病毒的蛋白质会攻击并杀死细胞。总之，蛋白质可以做任何事情 ：） " msgid "RAH_SC_FAQ_QE" msgstr "蛋白质如何完成所有这些各不相同的功能？" msgid "RAH_SC_FAQ_AE" msgstr "每种蛋白质都会折叠成独一无二的三维形状或结构。这个结构决定了蛋白质的功能。比如用来打破葡萄糖以便细胞可以从中吸取能量的蛋白质将会呈现一个能识别并附着在葡萄糖上面(就像锁和钥匙)的形状。它将具有能够和葡萄糖相互作用并打破它以释放能量的氨基酸。" msgid "RAH_SC_FAQ_QF" msgstr "为什么蛋白质会折叠成独一无二的结构？ " msgid "RAH_SC_FAQ_AF" msgstr "很早人们就已经认识到自然界中绝大多数的蛋白质都是热力学最小的。通俗的说，蛋白质的形状是所有它能呈现的形状中最稳定的。想像一个漏斗里面的球，它总是会滚回漏斗的底部，因为那是最稳定的状态。 " msgid "RAH_SC_FAQ_QG" msgstr "是什么作用力决定了蛋白质的独一无二的(最稳定的)自然结构？ " msgid "RAH_SC_FAQ_AG" msgstr "蛋白质中氨基酸的序列就决定了它的自然状态。由于氨基酸各不相同的化学属性，有些氨基酸会因为互相吸引(比如电荷相反的氨基酸)会连接在一起；还有些氨基酸因为不亲水(因为它们是油性的)，它们就会驱使蛋白质形成一个紧凑的形状，以至于不让水碰到藏在蛋白质核心中的氨基酸。 " msgid "RAH_SC_FAQ_QH" msgstr "为什么很难决定蛋白质的自然结构？ " msgid "RAH_SC_FAQ_AH" msgstr "即使是很小的蛋白质也包含100多个氨基酸。它所可能形成的构造的数目也将是一个天文数字，因为其中的自由度相当之多。要计算每一个可能状态的能量(以便我们可以找出哪一个是最稳定的)也是一个很难处理的。这个问题的复杂度与蛋白质的大小呈指数对应关系。而一些人类的蛋白质更是巨大(由上千个氨基酸组成)。 " msgid "RAH_SC_FAQ_QI" msgstr "那么 Rosetta 是怎么试图解决这个问题的？ " msgid "RAH_SC_FAQ_AI" msgstr "Rosetta 的理论基础，一是不同类型氨基酸间相互作用的物理及化学属性，二是对于每段氨基酸分支来说怎样的局部构造是可以接受的。如此就可以限制搜寻的范围，并评估各种可能构造的能量。只要对足够多的构造进行采样，Rosetta 就能找到蛋白质的能量最低、最稳定的自然结构。 " msgid "RAH_SC_FAQ_QJ" msgstr "为什么 Rosetta 的结构预测需要通过分布式计算来完成？ " msgid "RAH_SC_FAQ_AJ" msgstr "在许多蛋白质的自然结构已知的情况下，我们注意到Rosetta的能量函数能够证明自然状态比其它任何采样状态都要更为稳定。我们也注意到在随机构造时从来没有采样到过自然状态。因此如果能够提供给这个问题更多的计算资源，我们就能进行更多的采样并尝试不同的搜寻策略以找到最有效的方法。" msgid "RAH_SC_FAQ_QK" msgstr "$PROJECT 会对医学研究有帮助吗？ " msgid "RAH_SC_FAQ_AK" msgstr "请看我们网站上的 %s疾病相关研究%s 部分以了解 Rosetta 是如何应用于医学问题的。 " ################################# # rah_medical_relevance.php ################################# msgid "RAH_MED_COM_A" msgstr "来自 David Baker 的介绍" msgid "RAH_MED_COM_B" msgstr "我的小组主要涉及两个研究方向：1、开发基础的预测方法；2、尝试更直接找到对付重大疾病的方法。本站的内容大多都是介绍基础研究方面的。但我想，您可能对现实一点的问题更感兴趣，比如 $PROJECT 和我们正在进行的疾病相关的研究工作的关系。" msgid "RAH_MED_MALARIA" msgstr "疟疾： 我们参加了由伦敦帝国理工大学的 Austin Burt 领导的协作项目，该项目是盖茨基金会资助的“全球健康重大挑战项目”之一。疟疾的引起来源于一种在蚊子体内寄生的虫子。这些可恶的寄生虫通过蚊子对我们的叮咬跑到了人类的血液里面。而这种寄生虫在蚊子体内的生存依赖的就是蚊子的某几条基因。该项目的目的就是要从蚊子的 DNA 里把那条基因“去掉”。我们在项目中要做的就是通过计算方法(ROSETTA)得到一种新的酶来定位并阻止这些基因的活动。" msgid "RAH_MED_ANTHRAX" msgstr "炭疽： 我们正在使用 ROSETTA 来帮助 John Collier 的研究小组建立炭疽毒素的模型，其结果将有助于寻找有效的治疗方法。有关这方面的研究，您可以阅读这篇论文的概述： %s" msgid "RAH_MED_HIV" msgstr "HIV： 获得性人体免疫缺陷病毒(HIV 或 AIDS)为什么那么致命？是因为它们能骗过人类的免疫系统，使人体彻底失去保护。我们正在与西雅图和NIH(美国国家卫生研究所)的研究员们共同研制 HIV 的疫苗。我们利用 ROSETTA 来设计一种能找出 HIV 病毒表层蛋白质的少量关键区域的小蛋白质，这样免疫系统就可以轻松识别并产生抗体。本项目的目标是制造出小而稳定并且价格低廉的疫苗，然后把疫苗推广到全世界！ " msgid "RAH_MED_OV" msgstr "其他病毒： 我们正在与加州理工的 Pam Bjorkman 的实验室合作通过 ROSETTA 来构造疱疹病毒蛋白质与人类蛋白质的复合模型。" msgid "RAH_MED_ALZH" msgstr "阿尔茨海默氏症： 阿尔茨海默氏症的起因和很多疾病的一样都是由蛋白质的异常折叠引起的，蛋白质没有折叠成通常的生物活性状态，而是形成了称为淀粉体的大复合结构。最近，加州大学洛杉矶分校的 David Eisenberg 的研究小组在这一问题研究上取得了很大的进展。他们成功地得到了一个淀粉体的结构。我们正与他们合作，利用这个结构来预测蛋白质的哪些部分容易形成淀粉体。这将是阻止淀粉体形成和预防疾病的的第一步。 " msgid "RAH_MED_CANCER" msgstr "癌症： 癌症可能是由某些关键基因的突变引起，而这直接破坏了动物体细胞的正常运作。我们正在寻找能在 DNA 中找到突变基因的位置并进行切除的方法。切除之后，细胞会自动把未突变的备份基因信息补上去，这样细胞便不再是癌细胞了。这种基因疗法是非常有效的。如果成功，将取代现行的所有基因疗法。现在的基因疗法是将正常的基因备份随机的插入到基因组中。如果切入点不对，疾病仍然可能发生。因为我们的方法定位于特定地点而不是随机选择，将可以避免这一弊端。" msgid "RAH_MED_PC" msgstr "前列腺癌： 男性荷尔蒙受体(AR)可以对睾丸激素进行约束，且对男性的生长和发展起着关键作用。一旦 AR 对睾丸激素变得非常敏感，那么前列腺细胞就有可能癌变。现行的前列腺癌疗法是所谓的“激素疗法”，其目的是降低睾丸激素的数量(有时候可能通过阉割！)。这种疗法对很多恶性的肿瘤不起太大的效果，然而我们可以通过设计蛋白质来抑制 AR 和治疗前列腺癌。确切地说，我们的目的就是要设计蛋白质使得 AR 不再受睾丸激素影响。我们正尝试设计一种可以有效防止 AR 进入细胞核的蛋白质，而细胞核正是 AR 导致前列腺癌的地方。即便进入了细胞核，这种蛋白质也能阻止它激活那些癌变相关的基因。" msgid "RAH_MED_EXP" msgstr "因为我们还没有一个使人们可以方便地提交任务的队列系统，所以以上的项目都还没能在 BOINC 上运行。不过这只是暂时的，很快这些项目都会加入 BOINC 的大家庭中来！当然，现在您电脑上运行所的结构预测计算对于防治疾病来说也是具有重大意义的。以下三点对蛋白质结构预测与防治重大疾病间的直接联系进行了解释： " msgid "RAH_MED_EXP_A" msgstr "蛋白质结构预测和蛋白质设计是紧密相关的。" msgid "RAH_MED_EXP_B" msgstr "蛋白质预测技术的进步就意味着蛋白质设计技术的进步，而后者也意味着可以制造出新的酶和疫苗等。如果您想对蛋白质设计了解更多，您可能会有兴趣在我们的网站(%s)上看一篇我们最近发表在《科学》上的论文。

Schueler-Furman, O., Wang, C., Bradley, P., Misura, K., Baker, D. (2005). Progress in modeling of protein structures and interactions Science 310, 638-642." msgid "RAH_MED_EXP_C" msgstr "蛋白质结构预测可用来鉴别新的制药目标。" msgid "RAH_MED_EXP_D" msgstr "当我们大范围地预测人类基因蛋白质结构时，我们对许多蛋白质的功能会有新的了解，这将帮助我们了解细胞的工作原理和疾病是如何发生的。更直接的说，我们将能够鉴别新的制药目标并且能够为其设计出小的分子抑制物(药物)。我们在寻找重大疾病的治疗方法的过程中，最难办的就是要鉴别出新的可用来制药的蛋白质目标。目前，大多数的新药物针对的蛋白质目标都是和旧药物一样的，因此在疗效上只能有很小的提高。而蛋白质结构预测将有助于我们鉴别新的制药目标，并将帮助我们寻找创新的，也许是突破性的治疗方法。" msgid "RAH_MED_EXP_E" msgstr "蛋白质结构预测使我们可以通过“合理的设计”来创造新药物。" msgid "RAH_MED_EXP_F" msgstr "如果我们对一种蛋白质的结构有足够了解，我们就能确定它的功能点，并能通过新药物来抑制某些特定功能点。在许多方面，判断一种小分子(药物)是否会附着在蛋白质目标上并使其失去功能，与我们所做的蛋白质结构预测的计算是基本相同的 - 基本上就是寻找蛋白质和药物复合系统的最低能量结构的问题。而且最近我们也为 ROSETTA 添加了一个新的模块来解决蛋白质对接的问题。结果是十分令人鼓舞的。在不远的将来，您的机器除了做您目前正在做的关于蛋白质折叠的计算，很可能还在做和上面介绍的疫苗和治疗蛋白质设计项目相关的药物对接计算。" ######################################## # rah_graphics.php ####################################### msgid "RAH_VIZ_TITLE" msgstr "Rosetta 及其图像的快速向导" msgid "RAH_VIZ_ABOUT" msgstr "关于 Rosetta" msgid "RAH_VIZ_A" msgstr "Rosetta 的主要目标之一就是对蛋白质的折叠进行预测。蛋白质是由氨基酸组成的线性复合物分子，常被称之为“链”。氨基酸可以看作是蛋白质“链”上的“节”。这只是一个简单的类比。先来看一条金属链，我们可以任意改变它的形状。如果拉住两边，金属链会变成直线；如果扔在地上，它会随意地变成一个形状。金属链中的每一节都是相同的，而蛋白质却是由二十多种属性(形状，吸引和排斥的作用力等等)各不相同的氨基酸组成的，组合在一起后，各个氨基酸将会相互作用并使得蛋白质链呈现某个特定的形状，我们称之为“折叠”。蛋白质的折叠是由其链中氨基酸的连接顺序所决定的。蛋白质的种类有很多，包含的氨基酸的数量及次序各不相同。" msgid "RAH_VIZ_B" msgstr "要预测特定蛋白质的形状，我们其实是在寻找具有最低能量的折叠。能量是由很多因素决定的。例如有些氨基酸会由于互相吸引而在空间中靠得近，它们之间的相互作用将导致总体能量的降低。Rosetta 寻找最低能量形状的过程大致如下：" msgid "RAH_VIZ_C" msgstr "
  • 从没有任何折叠的链开始(就像一条被拉直的金属链)。
  • 移动链中的一部分，产生一个新的形状。
  • 计算新形状的能量。
  • 根据能量上的变化来决定是否接受这次的移动(否则就放弃)。
  • 重复 2～4 的步骤直到链中每一部分都移动了足够多的次数。" msgid "RAH_VIZ_D" msgstr "我们称上面的过程为一条轨迹，每条轨迹的最终结果就是预测出来的一个结构。Rosetta 会保存每条轨迹中找到的最低能量形状。每条轨迹都是独一无二的，因为每次尝试的移动都是随机决定的。过程中的可能性是如此之多以至于不可能找到同样的最低能量形态。" msgid "RAH_VIZ_E" msgstr "每条轨迹中都包含两个阶段。第一个阶段中使用简化表示的氨基酸序列以便我们可以快速地尝试各种可能性。本阶段是低分辨率的搜索，在屏保上你会看到蛋白质链大幅度的改变形状。在第二个阶段，Rosetta 使用完全表示的氨基酸序列。这个阶段称之为“弛豫”。蛋白质链不再大幅度移动，为了找到正确的氨基酸排布，它只会尝试小幅度的移动。本阶段是高分辨率的搜索，在屏保上你只会看到蛋白质链的轻微摆动。在一台主流的计算机上，Rosetta 完成第一阶段仅需要几分钟，而第二阶段因为完全表示的氨基酸序列导致的复杂性，将需要花费更长的时间。 " msgid "RAH_VIZ_F" msgstr "对于每一个任务包，你的计算机将要包含 5～20 次的轨迹，然后在完成后将发送给我们每条轨迹中的最低能量形状。我们将检查所有用户计算得到的低能量形状以找到最低的能量形态。这也就是我们对该蛋白质折叠的预测。 " msgid "SCREEN_SAVER" msgstr "屏保" msgid "RAH_VIZ_SS" msgstr "

    屏保会显示出每条轨迹正在进行时的进度：

    有四个框将显示蛋白质链的形状。" msgid "RAH_VIZ_SEARCH" msgstr "“Searching...” 显示的是当前蛋白质链正在尝试的移动。你可能看到链的形状以及由蓝到红的彩虹颜色。" msgid "RAH_VIZ_ACCEPTED" msgstr "“Accepted” 显示最近被接受的移动。" msgid "RAH_VIZ_LOW" msgstr "“Low Energy” 显示的是当前轨迹中的最低能量形状。" msgid "RAH_VIZ_NATIVE" msgstr "“Native” 显示的是在实验中得到的真实形状(如果已知的话)。" msgid "RAH_VIZ_G" msgstr "还有两条曲线和一张图即时地显示每次被接受的移动的能量及 RMSD。" msgid "RAH_VIZ_ACCEPTED_E" msgstr "“Accepted Energy” 显示的是当前轨迹中每次被接受的移动的能量。(横轴为当前轨迹的进度，纵轴为能量。)" msgid "RAH_VIZ_RMSD" msgstr "“RMSD” 表示时当前被接受的结构与真实结构的差距。(横轴为 RMSD，纵轴为进度。)" msgid "RAH_VIZ_RMSD_E" msgstr "最后一个在屏保右边中间的方框，显示的是每次被接受的移动的能量以及RMSD。这张图和网站上 %s最佳预测%s 页面显示的图相类似。不同的是你在屏保里看到的是每条轨迹中每次“被接受”的移动的情况。而在最佳预测页面仅显示每条轨迹的最低能量折叠。" ######################################### # rah_research.php ######################################## msgid "RAH_RESEARCH_TITLE_A" msgstr "大分子结构及交互作用的预测与设计" msgid "RAH_RESEARCH_INFO" msgstr "更多关于 $PROJECT 的详情，请看 %s这里%s。" msgid "RAH_RESEARCH_INTRO_A" msgstr "我们现在研究工作的目标是开发一种分子内和分子间交互作用的改良模型，并用这个模型来预测和设计大分子结构及其交互作用。这种预测和设计的应用，不仅自身就具有相当重要的生物学意义，而且为改进模型和加深基础性理解提供了严格且客观的测试。" msgid "RAH_RESEARCH_INTRO_B" msgstr "我们使用名为Rosetta的计算机程序来进行蛋白质结构预测及设计的计算。Rosetta的核心部分包括：计算大分子内或大分子间交互作用能量的势函数，发现氨基酸序列或蛋白质复合体最低级能量结构的方法（即蛋白质结构预测），及发现蛋白质或蛋白质复合体的最低能量氨基酸序列的方法（即蛋白质设计）。预测和设计测试的反馈被不断用于改进势函数和搜寻算法。开发一种能处理这些不同问题的计算机程序具有相当大的好处。首先，这些不同的应用提供了底层物理模型的互补性测试（当然，基本的物理或物理化学原理无论如何都是一样的）。其次，许多热门问题，如弹性主干蛋白质设计和具有主干弹性的蛋白质对接，都涉及了对不同最优化方法的结合。" msgid "RAH_RESEARCH_DESIGN_TITLE" msgstr "蛋白质结构设计" msgid "RAH_RESEARCH_DESIGN_A" msgstr "在过去的数年里，利用我们的蛋白质设计计算方法，我们重新设计了每一个序列的残基，从而戏剧般地使一些小蛋白质稳定下来，还重新设计了蛋白质主干构造，将单节显性蛋白质转化成二聚交换捆，掌握了对酶的热稳定方法。其中一个亮点是对蛋白质G的折叠路径的重新设计。蛋白质G是一个包含了被单alpha螺旋分隔的双beta折叠的小蛋白质。在自然形成的蛋白质中，第一个折叠被分裂，而第二个折叠以有限的速度形成。而在重新设计的变种中，第一个折叠相当稳定，第二个则被分裂，事件发生的顺序正好相反：第一个折叠形成时，第二个折叠在转换状态里被分裂。蛋白质折叠路径的重新设计能力合理地说明我们对蛋白质折叠的决定因素的了解已经大有进步。" msgid "RAH_RESEARCH_DESIGN_B" msgstr "最近极为令人激动的成果是任意选择三维结构创造出的新蛋白质。我们开发了一种通用的计算策略，用于创造这些能将完整的主干弹性整合进最优化螺旋异构体序列的蛋白质。而这是通过结合 Rosetta 的快速预测过程、原子级的能量修正和序列设计方法才完成的。此程序用于设计一个有93残基的蛋白质，它被称为 TOP7，有全新的序列和拓扑。TOP7 被发现是单节显性且折叠的，而且它的X光晶体结构和设计模型非常相似（RMSD为1.2埃，见图1的右侧）。新球型蛋白质折叠设计同设计模型晶体结构的紧密联系扩大了蛋白质设计和蛋白质结构预测之间的关联，打开了探索蛋白质宇宙中未知领域的大门。" msgid "RAH_RESEARCH_DESIGN_PPI_TITLE" msgstr "蛋白质交互作用设计" msgid "RAH_RESEARCH_DESIGN_PPI_A" msgstr "为将这些方法扩展到蛋白质间交互作用，尤其是交互作用的重新设计，我们选择了由大肠杆菌素E7 DNase和它的同源抑制免疫蛋白质形成的高亲和复合体作为模型系统。我们使用了上面描述的物理模型和修改过的基于螺旋异构体搜寻的计算设计策略，以生成新的预期会相互作用但不会和其它类型蛋白质发生作用的DNase抑制蛋白质对。最后设计出的蛋白质复合物有亚纳米的亲合度，在体内能发挥有效功能，在体外同源和非同源的蛋白质对的亲合度相差超过了一个数量级。这种方法可应用于非常精确的对活体细胞的描述和再工程中的交互蛋白质对的设计。" msgid "RAH_RESEARCH_DESIGN_PPI_B" msgstr "通过与 Barry Stoddard 和 Ray Monnat（%sFred Hutchinson癌症研究中心%s）的研究小组合作，we generated an artificial, highly specific endonuclease by fusing domains of homing endonucleases I-DmoI and I-CreI through computational optimization of a new domain-domain interface between these normally noninteracting proteins. The resulting enzyme, E-DreI (Engineered I-DmoI/I-CreI), binds a long chimeric DNA target site with nanomolar affinity, cleaving it precisely at a rate equivalent to its natural parents. We are currently trying to generate new endonucleases by extending our design methodology to protein--nucleic acid interfaces to redesign the protein-DNA interface." msgid "RAH_RESEARCH_DESIGN_PPI_C" msgstr "在这两种系统中都可以得到设计出的复合物的X射线晶体结构。就像 TOP7 的情况，实际的结构和设计模型是非常接近的（见图1左），这就验证了我们处理高精度模型的方法的精度。" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PS_TITLE" msgstr "蛋白质结构预测" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PS_A" msgstr "The picture of protein folding that motivates our approach to ab initio protein tertiary structure prediction is that sequence-dependent local interactions bias segments of the chain to sample distinct sets of local structures, and that nonlocal interactions select the lowest free-energy tertiary structures from the many conformations compatible with these local biases. In implementing the strategy suggested by this picture, we use different models to treat the local and nonlocal interactions. Rather than attempting a physical model for local sequence-structure relationships, we turn to the protein database and take the distribution of local structures adopted by short sequence segments (fewer than 10 residues in length) in known three-dimensional structures as an approximation to the distribution of structures sampled by isolated peptides with the corresponding sequences." msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PS_B" msgstr "The primary nonlocal interactions considered are hydrophobic burial, electrostatics, main-chain hydrogen bonding, and excluded volume. Structures that are simultaneously consistent with both the local sequence structure biases and the nonlocal interactions are generated by using simulated annealing to minimize the nonlocal interaction energy in the space defined by the local structure distributions." msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PS_C" msgstr "Rosetta 已经在两年一界的 %sCASP%s（蛋白质结构预测关键技术分析）大赛上进行了测试，该大赛要求对蛋白质序列的结构进行预测，而蛋白质的结构已经通过实验方法得到但还没有公开。自从 1998 年的 CASP3，Rosetta 一直是表现最好的预测程序之一，正如独立评审所报导的。比如在 CASP4 上，Rosetta 在21个蛋白质上进行了测试。这些蛋白质的序列与任何已知结构的蛋白质序列都不相同，而预测结果却是空前的准确和稳定。（部分结果见图2。）Rosetta 在 CASP5 和 CASP6 上也得到了非常好的预测结果。在这些不错的结果鼓励下，我们已经为所有长度小于150个氨基酸的蛋白质家庭生成了模型。" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PS_D" msgstr "CASP6 的亮点之一就是使用我们的高分辨率修正方法进行的初次盲测取得了相当不错的结果。相对短的序列(包含 76 个基)允许我们不仅对自然序列，同时也对许多同系物使用了全原子提修正方法。结构的最低能量簇中心和实际的结构相当接近(1.5 埃，见图3)。高精度修正方法将 RMSD 从 2.2 埃降低到了 1.5 埃。蛋白质核心处的旁链填充也是以类似于自然界的方式进行的。" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PS_E" msgstr "我们已经扩展了 Rosetta 的初始结构预测策略，可以从有限的实验数据来生成蛋白质的模型。通过将化学位移和 NOE 信息以及最近的两极偶合信息整合到 Rosetta 的结构预测过程中，我们已经能够比单纯的初始结构预测或是用传统的核磁共振（NMR）结构生成方法来处理同样有限的数据能得到更为精确的模型。近期一个激动人心的进步就是 Rosetta 已经可以使用未赋值的 NMR 数据，这样就不用对 NMR 数据进行困难而乏味的预处理了（assigning NMR spectra）。" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PS_F" msgstr "Rosetta 的初始结构预测方法，基于 Rosetta 的 NMR 结构判定方法，以及一种新的比较建模（使用 Rosetta 的方法对长环结构的部分进行建模，而这种结构不能基于同源结构模板来精确建模）都已经在一个称为 %sRobetta%s 的公共服务器上被实现。这台服务器是在 CASP5 和 CASP6 测试中最好的全自动结构预测服务器之一，长期在使用它的有来自世界各地的用户。" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PPI_TITLE" msgstr "蛋白质交互作用预测" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PPI_A" msgstr "多年来我们一直致力于蛋白质结构修正，因为过程中的自由度是如此之多，这是一个相当有挑战性的问题。而我们对蛋白质间的对接感兴趣是因为对接双方在接合过程中不会有大的结构变化，需要搜寻的空间，即刚体的六个自由度加上旁链接的自由度，也并不是太多。加上这个问题本身也是相当重要是，因此在处理更困难的结构修正问题前先解决这个问题也不错。" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PPI_B" msgstr "We developed a new method to predict protein-protein complexes from the coordinates of the unbound monomer components. This method employs a low-resolution, rigid-body, Monte Carlo search followed by simultaneous optimization of backbone displacement and side-chain conformations with the Monte Carlo minimization procedure and physical model used in our high-resolution structure prediction work. The simultaneous optimization of side-chain and rigid-body degrees of freedom contrasts with most other current approaches, which model protein-protein docking as a rigid-body shape-matching problem, with the side chains kept fixed. We have recently improved the method (RosettaDock) by developing an algorithm that allows efficient sampling of off-rotamer side-chain conformations during docking." msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PPI_C" msgstr "RosettaDock 的效果在2004年11月举行的 %sCAPRI%s 中的蛋白质对接盲试挑战中相当引人注意。在 CAPRI 上，给定两个已知会复合的蛋白质结构，要求预测出复合物的结构。RosettaDock 得到的聚合物的主干部分准确度非常高（见图4）。不仅主干的朝向预测几乎完美，接口处的旁链也都相当精确。这些正确模型的能量比其它我们生成的模型的能量都要低，这就说明势函数是相当精确的。" msgid "RAH_RESEARCH_PRED_PPI_D" msgstr "这些有希望的结果表明该方法也许不久就能用于由孤立组件结构来生成生物学上有重要意义的复合物模型，更一般地，还表明不久就能得到高精度的结构及交互作用模型。我们在单节显性结构预测方面的明确目标就是这种高精度的模型。" msgid "RAH_RESEARCH_IMPROV_TITLE" msgstr "物理模型的改进" msgid "RAH_RESEARCH_IMPROV" msgstr "我们目前改进能量函数的途径包括：针对小复合物模型的量子化学计算，传统的分子力学方法，以及蛋白质结构分析。We have used such an approach to develop an improved hydrogen-bonding potential. A particularly notable result is that the orientation dependence of the hydrogen bond in quantum chemistry calculations on formamide dimers is remarkably similar to that seen in side-chain--side-chain hydrogen bonds in protein structures but different from that in current molecular mechanics force fields, which neglect the covalent character of the hydrogen bond. Feedback from the prediction and design calculations has provided continual impetus and guidance for improving the energy function; for example, inadequacies in our treatment of protein-protein interactions have led to the recent development of a rotamer-based model for water-mediated hydrogen bonds." msgid "RAH_RESEARCH_FUTURE_TITLE" msgstr "长远计划" msgid "RAH_RESEARCH_FUTURE_A" msgstr "我们的预测及设计方法已经可以用于解决重要的生物学问题。经过多年在高精度模型方面的努力，特别振奋人心的有：在 CAPRI 中接近原子精度的复合物结构预测(见图4)，在 CASP6 中 RMSD 为1.5埃的重新预测(见图3)，TOP7(见图1右)与蛋白质接口设计模型(见图1左)和通过X射线得到的晶体结构的符合。这些结果都意味着高精度的模型已经开始发挥作用了。" msgid "RAH_RESEARCH_FUTURE_B" msgstr "接下来几年，我们将进一步改进和扩展我们的方法。尤其是提高高精度结构预测的精度，如果要得到可以广泛使用的模型这是必须的。为了达到这个目标，我们将努力改进对底层物理模型的理解和采样方法。我们正在开发改进的蛋白质和DNA交互作用的预测和设计方法，我们还在扩展我们的蛋白质设计方法，使其能设计出可用于催化那些自然界中蛋白质无法催化的化学反应的酶。" msgid "RAH_RESEARCH_END" msgstr "请访问我们的网站（%s）以了解更多信息（包括一些研究出版物）。" msgid "RAH_RESEARCH_FIG_A" msgstr "图1：高精度的蛋白质及蛋白质间交互作用的设计。设计模型和晶体结构的比较，左边是带有新的 DNA 分裂特性的核酸内切酶的接口，右边是全新设计的蛋白质 TOP7。

    左图来自 Tanja Kortemme。右图来自 Gautam Dantas。" msgid "RAH_RESEARCH_FIG_B" msgstr "图2：CASP3 和 CASP4 中的蛋白质结构预测盲试。

    A: Left, crystal structure of the MarA transcription factor bound to DNA; right, our best submitted model in CASP3.Despite many incorrect details, the overall fold is predicted with sufficient accuracy to allow insights into the mode of DNA binding.

    B: Left, the crystal structure of bacteriocin AS-48; middle, our best submitted model in CASP4; right, a structurally and functionally related protein (NK-lysin) identified using this model in a structure-based search of the Protein Data Bank (PDB). The structural and functional similarity is not recognizable using sequence comparison methods (the identity between the two sequences is only 5 percent).

    C: Left, crystal structure of the second domain of MutS; middle, our best submitted model for this domain in CASP4; right, a structurally related protein (RuvC) with a related function recognized using the model in a structure-based search of the PDB. The similarity was not recognized using sequence comparison or fold recognition methods.

    Image: Rich Bonneau" msgid "RAH_RESEARCH_FIG_C" msgstr "图3：首次接近原子级别精度的初始结构预测 －CASP6 T281。文章中描述的高精度修正方法得到的晶体结构（图左）的 RMSD 为1.5埃，并且其旁链填充情况是自然的（图右）。

    图片由 Phil Bradley 提供。" msgid "RAH_RESEARCH_FIG_D" msgstr "图4：CAPRI（蛋白质相互作用预测关键技术分析大赛）上的蛋白质对接结果。Superposition of predicted (blue) and x-ray (red and orange) protein complex structures. Green, a side chain whose conformation was correctly predicted to change upon complex formation. Upper panel, whole complex. Lower panel, details of the interface. In addition to the rigid-body orientation, the conformations of most of the side chains are predicted correctly.

    Image: Ora Furman"